Identification of cotton non-pathogenic fungal agent isolates based on morphological and MALDI-TOF mass spectrometry method

Basit Öğe Kaydı
dc.authorid0009-0001-5977-6087
dc.authorid0000-0002-9475-0421
dc.contributor.authorKaradaşlı, Adalet
dc.contributor.authorKavak, Hamit
dc.date.accessioned2025-03-08T18:29:47Z
dc.date.available2025-03-08T18:29:47Z
dc.date.issued2024
dc.departmentDicle Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Bitki Kuruma Bölümü
dc.description.abstractIn this study, morphological and MALDI-TOF MS identification and comparison of non-pathogenic fungal species isolated from diseased root, leaf and boll tissues of cotton plants were carried out. For this purpose, surveys were conducted in Bağlar, Sur, Çınar, Bismil, Yenişehir, Ergani, Eğil, Kayapınar and Silvan districts of Diyarbakır province where cotton production is intensive between June and September 2020 and 2021. 209 samples of plants showing typical fungal disease symptoms were collected from 75 different cotton production areas. A total of 171 fungal isolates were obtained by isolation, culture and purification procedures from diseased plant tissues in the samples. The 20 isolates that were negative in the pathogenicity test in the main host were identified and compared by morphological (traditional) and MALDI-TOF MS methods. According to the results, Aspergillus niger, Aspergillus flavus, Aspergillus terreus, Aspergillus fumigatus, Aspergillus minisclerotigenes, Penicillium nalgıovense, Chaetomium globosum, Dichotomopilus funicola, Arthroderma gloria, Pseudogmnoacus pannorum, Tichophyton interdigitale, and Penicillium sp. Penicillium sp. were found to be intensively colonized in different parts of cotton such as leaves, bolls and roots. Again, it was determined that the most common species among the total saprophyte isolates was Aspergillus niger with a high similarity rate.
dc.description.abstractBu çalışmada pamuk bitkisinin hastalıklı kök, yaprak ve koza dokularından izole edilmekle beraber, patojen özellik göstermeyen fungus türlerinin morfolojik ve MALDI-TOF MS yöntemine bağlı teşhis ve karşılaştırması yapılmıştır. Bu amaç için 2020 ve 2021 in Haziran – Eylül ayları arasında pamuk üretiminin yoğun olarak yapıldığı Diyarbakır ilinin Bağlar, Sur, Çınar, Bismil, Yenişehir, Ergani, Eğil, Kayapınar ve Silvan ilçelerinde surveyler yapılmıştır. 75 farklı pamuk üretim alanından tipik fungal hastalık belirtileri gösteren bitkilerden 209 adet örnek toplanmıştır. Örneklerdeki hastalıklı bitki dokularından izolasyon, kültür ve saflaştırma işlemleri yapılarak toplam da 171 adet fungal izolat elde edilmiştir. Ana konukçudaki patogenisite testinde negatif çıkan 20 izolat morfolojik (geleneksel) ve MALDI-TOF MS yöntemiyle teşhis edilmiş ve karşılaştırılmıştır. Sonuçlara göre, Aspergıllus niger, Aspergillus flavus, Aspergıllus terreus, Aspergillus fumigatus, Aspergıllus minisclerotigenes, Penicillium nalgıovense, Chaetomium globosum , Dichotomopilus funicola, Arthroderma gloria, Pseudogmnoacus pannorum, Tichophyton interdigitale türleriyle beraber Penicillium sp. cinsine ait fungus türlerinin pamuğun hastalık belirtisi sergileyen yaprak koza ve kök gibi farklı kısımlarında yoğun olarak kolonize olduğu belirlenmiştir. Yine toplam saprofit izolatlar içerisinde en yaygın türün ise Aspergillus niger olduğu yüksek benzerlik oranı ile tespit edilmiştir.
dc.identifier.citationKaradaşlı, A., & Kavak, H. (2024). Identification of cotton non-pathogenic fungal agent isolates based on morphological and MALDI-TOF mass spectrometry method. Turkish Journal of Agricultural and Natural Sciences, 11(4), 1161-1167.
dc.identifier.doi10.30910/turkjans.1477542
dc.identifier.endpage1167
dc.identifier.issn2148-3647
dc.identifier.issue4
dc.identifier.startpage1161
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.30910/turkjans.1477542
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11468/32085
dc.identifier.volume11
dc.institutionauthorKaradaşlı, Adalet
dc.institutionauthorKavak, Hamit
dc.institutionauthorid0009-0001-5977-6087
dc.institutionauthorid0000-0002-9475-0421
dc.language.isoen
dc.publisherMevlüt AKÇURA
dc.relation.ispartofTürk Tarım ve Doğa Bilimleri Dergisi
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanı
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.snmzKA_DergiPark_21250205
dc.subjectCotton
dc.subjectNon Pathogen
dc.subjectFungal
dc.subjectIsolate
dc.subjectPamuk
dc.subjectPatojen
dc.subjectFungal
dc.subjectİzolat
dc.titleIdentification of cotton non-pathogenic fungal agent isolates based on morphological and MALDI-TOF mass spectrometry method
dc.title.alternativeMorfolojik ve MALDI-TOF kütle spektrometresi yöntemine dayalı pamuk patojenik olmayan mantar ajanı izolatlarının tanımlanması
dc.typeArticle

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
10.30910-turkjans.1477542-3901909.pdf
Boyut:
370.28 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
İndir

Koleksiyon

Bitki Koruma Bölümü Koleksiyonu
TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu