Exploring genetic diversity and population structure of Turkish black sea region maize (Zea mays L.) germplasm using SSR markers

Yükleniyor...
Küçük Resim

Tarih

2022

Dergi Başlığı

Dergi ISSN

Cilt Başlığı

Yayıncı

Erzincan Binali Yıldırım Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü

Erişim Hakkı

info:eu-repo/semantics/openAccess

Özet

This study aimed to investigate the genetic diversity and population structure of 32 local maize genotypes collected from the Black Sea Region of Turkey using SSR markers. 14 most polymorphic primers yielded a total of 42 bands. An average of 3 alleles per SSR primer was detected, and the number of alleles varied from 1 (phi022) to 6 (umc1571). The unweighted pair-group method with arithmetic means (UPGMA) clustering divided maize accessions into three main populations. According to Nei's genetic distances, DZ-M-145 (Corum) and DZ-M-20 (Trabzon) genotypes were the closest (0.03) genetically related populations, while DZ-M-68 (Artvin) and DZ-M-55 (Rize) were the most genetically distant (0.63) populations. The study identified molecular genetic diversity not mentioned for maize plants from the Black Sea.
Bu çalışma, Türkiye'nin Karadeniz Bölgesi'nden toplanan 32 yerel mısır genotipinin SSR belirteçleri kullanılarak genetik çeşitliliğini ve popülasyon yapısını araştırmayı amaçlamıştır. Moleküler karakterizasyon çalışmasında toplamda 42 bant veren en polimorfik 14 primer kullanılmış, SSR primeri başına ortalama 3 alel saptanmış ve alel sayısı 1 (phi022) ile 6 (umc1571) arasında değişim göstermiştir. UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) yöntemi, mısır aksesyonlarını üç ana popülasyona bölmüştür. Nei'nin genetik mesafelerine göre, DZ-M-145 (Çorum) ve DZ-M-20 (Trabzon) genotipleri genetik olarak en yakın (0.03) popülasyonlar iken, DZ-M-68 (Artvin) ve DZ-M-55 (Rize) genetik olarak en uzak (0.63) popülasyonlar olarak tespit edilmiştir. Çalışma, Karadeniz'deki mısır bitkileri için daha önce bahsedilmeyen moleküler genetik çeşitliliği tanımıştır.

Açıklama

Anahtar Kelimeler

SSR, Maize, Genetic, Local maize populations, Molecular characterization, Mısır, Genetik, Yerel mısır popülasyonları, Moleküler karakterizasyon

Kaynak

Erzincan Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi

WoS Q Değeri

Scopus Q Değeri

Cilt

15

Sayı

3

Künye

Baran, N., Nadeem, M. A., Yılmaz, A., Andırman, M., Kurt, F., Temiz, M. G. ve diğerleri. (2022). Exploring genetic diversity and population structure of Turkish black sea region maize (Zea mays L.) germplasm using SSR markers. Erzincan Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 15(3), 953-963.