Exploring genetic diversity and population structure of Turkish black sea region maize (Zea mays L.) germplasm using SSR markers
Yükleniyor...
Tarih
2022
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Erzincan Binali Yıldırım Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
This study aimed to investigate the genetic diversity and population structure of 32 local maize genotypes
collected from the Black Sea Region of Turkey using SSR markers. 14 most polymorphic primers yielded a
total of 42 bands. An average of 3 alleles per SSR primer was detected, and the number of alleles varied from
1 (phi022) to 6 (umc1571). The unweighted pair-group method with arithmetic means (UPGMA) clustering
divided maize accessions into three main populations. According to Nei's genetic distances, DZ-M-145 (Corum)
and DZ-M-20 (Trabzon) genotypes were the closest (0.03) genetically related populations, while DZ-M-68
(Artvin) and DZ-M-55 (Rize) were the most genetically distant (0.63) populations. The study identified
molecular genetic diversity not mentioned for maize plants from the Black Sea.
Bu çalışma, Türkiye'nin Karadeniz Bölgesi'nden toplanan 32 yerel mısır genotipinin SSR belirteçleri kullanılarak genetik çeşitliliğini ve popülasyon yapısını araştırmayı amaçlamıştır. Moleküler karakterizasyon çalışmasında toplamda 42 bant veren en polimorfik 14 primer kullanılmış, SSR primeri başına ortalama 3 alel saptanmış ve alel sayısı 1 (phi022) ile 6 (umc1571) arasında değişim göstermiştir. UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) yöntemi, mısır aksesyonlarını üç ana popülasyona bölmüştür. Nei'nin genetik mesafelerine göre, DZ-M-145 (Çorum) ve DZ-M-20 (Trabzon) genotipleri genetik olarak en yakın (0.03) popülasyonlar iken, DZ-M-68 (Artvin) ve DZ-M-55 (Rize) genetik olarak en uzak (0.63) popülasyonlar olarak tespit edilmiştir. Çalışma, Karadeniz'deki mısır bitkileri için daha önce bahsedilmeyen moleküler genetik çeşitliliği tanımıştır.
Bu çalışma, Türkiye'nin Karadeniz Bölgesi'nden toplanan 32 yerel mısır genotipinin SSR belirteçleri kullanılarak genetik çeşitliliğini ve popülasyon yapısını araştırmayı amaçlamıştır. Moleküler karakterizasyon çalışmasında toplamda 42 bant veren en polimorfik 14 primer kullanılmış, SSR primeri başına ortalama 3 alel saptanmış ve alel sayısı 1 (phi022) ile 6 (umc1571) arasında değişim göstermiştir. UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) yöntemi, mısır aksesyonlarını üç ana popülasyona bölmüştür. Nei'nin genetik mesafelerine göre, DZ-M-145 (Çorum) ve DZ-M-20 (Trabzon) genotipleri genetik olarak en yakın (0.03) popülasyonlar iken, DZ-M-68 (Artvin) ve DZ-M-55 (Rize) genetik olarak en uzak (0.63) popülasyonlar olarak tespit edilmiştir. Çalışma, Karadeniz'deki mısır bitkileri için daha önce bahsedilmeyen moleküler genetik çeşitliliği tanımıştır.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
SSR, Maize, Genetic, Local maize populations, Molecular characterization, Mısır, Genetik, Yerel mısır popülasyonları, Moleküler karakterizasyon
Kaynak
Erzincan Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
15
Sayı
3
Künye
Baran, N., Nadeem, M. A., Yılmaz, A., Andırman, M., Kurt, F., Temiz, M. G. ve diğerleri. (2022). Exploring genetic diversity and population structure of Turkish black sea region maize (Zea mays L.) germplasm using SSR markers. Erzincan Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 15(3), 953-963.
