Yazar "Bilden, Alican" seçeneğine göre listele
Listeleniyor 1 - 10 / 10
Sayfa Başına Sonuç
Sıralama seçenekleri
Öğe 2011-2020 yılları arasında Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi’ne başvuran hastalarda bağırsak parazitlerinin dağılımının retrospektif olarak değerlendirilmesi(Galenos Yayınevi, 2022) Akpolat, Nezahat; Çakır, Fatih; Çiçek, Mutalip; Bilden, AlicanAmaç: Bu çalışmada, 2011-2020 yılları arasında Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Parazitoloji Laboratuvarı’na başvuran hastalarda tespit edilen bağırsak parazitlerin dağılımının retrospektif olarak değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Yöntemler: Parazit incelemesi için parazitoloji laboratuvarına gönderilen dışkı numuneleri native-Lugol yöntemi ve selofan bant ile gönderilen numuneler ise direkt mikroskobi ile incelenmiştir. Ayrıca protozoonların tanımlanmasında modifiye asitfast ve trikrom boyama yöntemi kullanılmıştır. Bulgular: Parazitoloji laboratuvarına gönderilen 60,501 Gaita numunesinin %5,99’unda parazit tespit edildi. Bu parazitlerin içerisinde %57,62 ile Blastocystis spp. en yüksek oranda saptandı, bunun dışında saptanan diğer parazitler ise sırasıyla Giardia intestinalis %31,93, Entamoeba histolytica/dispar %3,75, Hymenelopis nana %2,37, Fasciola spp., %1,57, Taenia spp. %0,91, Enterobius vermicularis %0,72, Cryptosporidium spp.%0,52, Cyclospora cayatenensis %0,42, Ascaris lumbricoides ise %0,19 oranında idi. Sonuç: Çalışmamızda bağırsak parazit enfeksiyonlarının görülme oranları on yıllık süre içinde azalma gösterse de önemini korumaya devam etmektedir. Bu nedenle, bağırsak parazitlerinin prevalansının azaltılması için; temiz su kaynaklarının korunması, alt yapı sorunlarının giderilmesi, toplumun sanitasyon kuralları hakkında bilgilendirilmesi gerekmektedir.Öğe Antibiotic Susceptibility Patterns of Gram-Negative Anaerobic Bacteria Isolated from Clinical Samples(Veysi AKPOLAT, 2023) Bilden, Alican; Atmaca, Selahattin; Özcan, NidaAmaç: Anaerop bakteriler vücudun normal flora elemanı olmasına karşın, bağışıklık sisteminin zayıflamasıyla enfeksiyona neden olabilirler. Bu bakterilerin izolasyonları ve identifikasyonları güç olduğu için çoğu laboratuvarda yapılmamaktadır. Bu sebeple çoğu zaman anaerop bakteriler göz ardı edilebilmektedir. Bunun sonucu olarak da gelişen antibiyotik direnç durumları tespit edilememektedir. Bizim bu çalışmadaki amacımız, anaerop bakterilerin antibiyotik direnç profillerinin bilinmesinin tedavinin seyri açısından gerekli olduğunu ve belirli periyodlarda antibiyotik duyarlılık testlerinin yapılması gerektiğini ortaya koymaktır. Metod: Çalışmaya, Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD. Bakteriyoloji/Kültür laboratuvarına, çeşitli klinik birimlerden anaerop kültür istemiyle gönderilmiş 372 numune dahil edilmiştir. Bu numuneler, ilk olarak bakteri izolasyonu için Brucella kanlı agara ekildi. İzole edilen bakterilerin identifikasyonları MALDI-TOF MS ile yapıldıktan sonra antimikrobiyal duyarlılık profillerinin belirlenmesi için E – test yöntemi kullanıldı. Bulgular: İzole edilen 17 Bacterioides türünde antimikrobiyal direncin en yüksek olduğu antibiyotikler sırasıyla % 100 oranında penisilin (P), % 41,2 oranında klindamisin (CM) ve % 35,3 oranında ise amoksisillin-klavulanik asid (AMC) olarak belirlendi. İzole edilen 22 Prevotella türünde ise antimikrobiyal direncin en yüksek olduğu antibiyotikler % 45,5 oranında penisilin (P) ve % 27,3 oranında moksifloksasin (MX) olarak belirlendi. Yine izole edilen 1 Dialister pneumosintes bakterisinde sadece metronidazol (MZ) direnci gözlemlenirken, 1 Veillonella parvula bakterisinde ise penisilin (P), imipenem (IP) ve piperasillin-tazobaktam (TPZ) antibiyotiklerine karşı direnç gözlemlenmiştir. Son olarak da izole edilen 4 Fusobacterium türünde ise hiçbir antibiyotiğe karşı direnç gözlemlenmemiştir. Sonuç: Çalışmamızda izole edilen Gram-negatif anaerop bakterilerin büyük çoğunluğunun penisilin, klindamisin, moksifloksasin, metronidazol ve amoksisillin-klavulanik aside karşı bir direnç geliştirdiği veya bu antibiyotiklere karşı artan bir dirence sahip olduğu görülmüştür. Anahtar Sözcükler: Gram-Negatif Anaerop Bakteriler, E-Test, MIC, MALDI-TOF MSÖğe Contested role of procalcitonin and C-reactive protein in the diagnosis of fascioliasis(Egyptian Parasitologists United Society, 2022) Çakır, Fatih; Bilden, Alican; Özcan, Nida; Çiçek, MutalipBackground: Procalcitonin (PCT) and C-reactive protein (CRP) are acute phase reactants indicating inflammation, particularly in bacterial infections. High PCT or CRP levels were proposed in malaria, invasive amoebiasis, babesiosis and schistosomiasis. Since liver is the sole habitat, it was hypothesized that PCT and CRP may have a role in the diagnosis of fascioliasis. Objective: The study aimed to investigate whether PCT and CRP have a role in the diagnosis of fascioliasis. Subjects and Methods: Fifty fascioliasis patients and 50 healthy blood donors in the same age range, as the control group, were included in the study. Fascioliasis was diagnosed by anti-Fasciola IgG ELISA, in addition, direct stool examinations (fresh smear and after sedimentation) were performed in both groups. Serum PCT and CRP levels were determined by I-chroma kits on I- CHROMATM II device, and NFL BN-II immunonephelometry system, respectively. Results: There was no statistically significant difference of PCT and CRP values between the fascioliasis patient group and the control group (P> 0.05). Conclusion: It was concluded that PCT and CRP were not relevant parameters for diagnosis of fascioliasis.Öğe Culture and culture-independent diagnostic tests in Campylobacter enteritis(Journal of Infection Developing Countries, 2022) Özcan, Nida; Bacalan, Fatma; Çakır, Fatih; Bilden, Alican; Genişel, Neslihan; Dal, TubaIntroduction: Campylobacter infections are among the most common causes of bacterial enteritis. This study aims to determine the sensitivity, specificity and positive predictive values (PPV) of culture and culture-independent tests for the diagnosis of Campylobacter enteritis. Methodology: A total of 400 stool samples were included in the study. BD MAX enteric bacterial panel (BD Diagnostics, Franklin Lakes, NJ, USA) and EntericBio Gastro Panel II (Serosep, Limerick, Ireland) were used as commercial molecular tests. RIDA??QUICK Campylobacter (R-Biopharm, Darmstadt,, Germany) and CerTest (Biotec, Zaragoza, Spain) were used to detect Campylobacter antigens. Samples were cultured in CCDA media and subjected to bacterial identification by mass spectrometry. Results: Among the 400 specimens, 41 (10.2%) were evaluated as Campylobacter positive; 21 were culture-positive and 20 were detected as positive by both PCR methods. Of the 21 isolates grown in culture, 16 (76.2%) were identified as C. jejuni and 5 (23.8%) as C. coli. While all 21 culture-positive specimens were detected as positive by both molecular tests, 18 of the specimens were found positive by RidaQuick, and 16 by Certest ICA. Of the 20 culture-negative Campylobacter cases, 18 were positive by RidaQuick and 12 by Certest ICA. Sensitivities of culture, ICA-RidaQuick and ICA-CerTest were 51.2%, 87.8 and 68.3, respectively. The specificities of all tests were in the range of 90-100 %. PPV of molecular tests, ICA-RidaQuick and ICA-CerTest were > 95%, 72 % and 48.3 %, respectively. Conclusions: Molecular tests were superior to culture and ICA in terms of sensitivity, specificity, and positive predictive value.Öğe Does neutrophil/lymphocyte ratio contribute to diagnostics in patients with fascioliasis?(A. CARBONE Editore, 2018) Çiçek, Mutalip; Deveci, Özcan; Cengiz, Zeyneptaş; Bilden, Alican; Bilik, Özge AlkanIntroduction: Fasciolia sp. is a trematode causes infection by settling in the liver bile ducts of domestic animal and human liver. Fascioliasis is a parasite disease that might have changes in liver parenchyma and in bile ducts. Many inflammatory reactions occur during the settlement of larvae and mature parasites into the liver. The neutrophil/lymphocyte ratio (NLR) has become a prominent marker of underlying inflammation. The objective of the present study is to investigate the relationship between the hematological parameters in patients with fascioliasis. Materials and methods: The diagnosis of fascioliasis was based on patient history, clinical and laboratory findings, radiological imaging (ultrasound), stool examination and IgG antibody titer determination by ELISA. Clinical and laboratory data were collected for 56 patients with fascioliasis, and diagnosed with serological and radiological imaging. 56 healthy volunteers were selected for the control group. Stool and blood samples were collected from patients with fascioliasis for serologic, biochemical, hematologic tests and ova examination. Total leukocyte, neutrophil, eosinophil and lymphocyte counts were recorded and NLR was calculated. ELISA antibody cut off titer value of patients with fascioliasis was 10> positive. Results: We compared neutrophil/lymphocyte ratio, eosinophil/lymphocyte ratio, the relation of eosinophilia and IgG antibody titers between two groups (patient and control groups). There was no statistically significant difference between patients and healthy controls neither based on age and gender nor NLR. According to these findings, NLR can not be considered as a diagnostic marker in fascioliasis. Conclusion: As a result, it was determined that NLR is not a crucial indicator of inflammation in parasitic fascioliasis. Extensive studies are need to be done to clarify the correlation between NLR and progression of other parasitic diseases.Öğe Evaluation of the seroprevalence and the demographic and clinical findings of fascioliasis patients in the Dicle River Basin in Turkey: a nine-year experience at a university hospital(Verduci Publisher, 2023) Çiçek, Mutalip; Yalçın, Kendal; Bilden, Alican; Çakır, Fatih; Akpolat, NezahatOBJECTIVE: Fasciola hepati-ca and Fasciola gigantica are liver trematodes that cause fascioliasis in humans and animals. In Turkey, the medical importance of fascioliasis has been increasing in humans, and it continues to cause great economic loss in the field of an -imal husbandry. Therefore, it is important to di-agnose fascioliasis quickly and reliably. The aim of this study is to show that the ELISA test is a reliable and specific method for diagnosing fas-cioliasis both in the early stage and in the acute stage.PATIENTS AND METHODS: In this study, 640 individuals aged 7-75 years who showed one or more symptoms of fascioliasis, such as abdom-inal pain, fever, weight loss, weakness, fatigue, headache, sweating, nausea, vomiting, allergic urticaria, liver mass, hypereosinophilia, or liver enzyme elevation, were recruited from the Dicle University Research and Application Hospital in southeastern Turkey. Serum and fecal samples were taken from them to investigate if the Fas-ciola hepatica IgG antibody was present in the serum and if eggs were present in the feces. To detect the IgG antibodies, an enzyme-linked im-munosorbent assay (ELISA) kit was used. The stool samples were analyzed for three consec-utive days in mini Parasep fecal parasite con-centrator tubes using the native-lugol and sed-imentation methods. Abdominal ultrasonogra-phy and computed tomography were performed in all the patients.RESULTS: Among the subjects of this study, 90 (14%) were positive for fascioliasis, of whom 85 (94.4%) were adults and 5 (5.5%), children; 73 (81.1%) were women and 17 (18.8%), men; 57 (63.3%) lived in the rural areas and 33 (36.6%), in the city center; 90 (14%) were positive for Fasci-ola hepatica IgG antibodies; (20%) had helminth eggs in their stools; and 85 (94.4%) had a histo-ry of eating watercress.CONCLUSIONS: According to the epidemio-logical classification for fascioliasis by Mas -Co-ma, the Dicle Basin, which is the setting of this study, is indeed a hyperendemic region. Thus, ELISA is a reliable and specific method of diag-nosing fascioliasis, both in the early phase and in the acute phase, when the eggs are no longer seen in the stool.Öğe The interaction methylene blue and glutathione-S-transferase purified from human erythrocytes(Springer Heidelberg, 2020) Uzan, Serhat; Acay, Hilal; Baran, M. Firat; Bilden, Alican; Aygun, HusamettinIt is known that textile dyes have various risks on human health. Glutathione-S-transferase enzymes play a critical role in the detoxification of xenobiotics in living systems. This study aimed to examine the interaction of methylene blue with human erythrocyte glutathione-S-transferase purified in one step. Human erythrocyte glutathione-S-transferase was purified with approximately 750-fold purification and 30% efficiency by glutathione agarose affinity chromatography. The results showed that the enzyme was inhibited by methylene blue with an IC(50)value of 1.40 mmol/L. The Ki constant of methylene blue was 1.17 mmol/L. The Lineweaver-Burk graph of the methylene blue showed that the type of inhibition was compatible with mixed type inhibition. A new third spot was also detected by thin-layer chromatography. Furthermore, the cytotoxicity of methylene blue on human erythrocytes was evaluated and it was found that the haemolysis per cent of methylene blue on erythrocytes was approximately 14%.Öğe Klinik örneklerden soyutlanan gram negatif anaerop bakterilerin antibiyotik duyarlılık paternleri(Dicle Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, 2020) Bilden, Alican; Atmaca, SelahattinAmaç:Anaeropbakteriler vücudun normal flora elemanı olmasına karşın, bağışıklık sisteminin zayıflamasıyla enfeksiyona neden olabilirler. Bu bakterilerin izolasyonları ve identifikasyonları güç olduğu içinçoğu laboratuvarda yapılmamaktadır. Bu sebeple çoğu zaman anaerop bakteriler göz ardı edilebilmektedir.Bunun sonucu olarak da gelişen antibiyotik direnç durumları tespit edilememektedir.Bizim bu çalışmadaki amacımız, anaerop bakterilerin antibiyotik direnç profillerinin bilinmesinin tedavinin seyri açısından gerekli olduğunu ve belirli periyodlarda antibiyotik duyarlılık testlerinin yapılması gerektiğini ortaya koymaktır.Gereç ve Yöntem:Çalışmaya, 11.06.2019 -04.03.2020tarihleri arasında Dicle Üniversitesi Tıp FakültesiTıbbi Mikrobiyoloji AD. Bakteriyoloji/Kültür laboratuvarına, çeşitli klinik birimlerden anaerop kültür istemiylegönderilmiş372 numune dahil edilmiştir. Bu numuneler, ilk olarak bakteri izolasyonu için Brucellakanlı agara ekildi.İzole edilen bakterilerin identifikasyonlarıMALDI-TOF MS ile yapıldıktan sonra antimikrobiyal duyarlılık profillerinin belirlenmesi için E –test yöntemi kullanıldı.Bulgular:İzole edilen 17 Bacterioidestüründe antimikrobiyal direncin en yüksekolduğu antibiyotiklersırasıyla % 100 oranındapenisilin(P), % 41,2oranındaklindamisin (CM)ve % 35,3oranındaise amoksisillin-klavulanik asid (AMC)olarak belirlendi.İzole edilen 22 Prevotellatüründe iseantimikrobiyal direncin en yüksekolduğu antibiyotikler% 45,5oranındapenisilin(P) ve % 27,3 oranındamoksifloksasin (MX)olarak belirlendi. Yine izole edilen 1 Dialister pneumosintesbakterisinde sadecemetronidazol (MZ)direnci gözlemlenirken, 1 Veillonellaparvulabakterisindeise penisilin(P),imipenem(IP)ve piperasillin-tazobaktam (TPZ)antibiyotiklerine karşı direnç gözlemlenmiştir. Son olarakdaizole edilen 4Fusobacteriumtüründeise hiçbir antibiyotiğe karşı direnç gözlemlenmemiştir. Sonuç:Çalışmamızda izole edilen Gram-negatifanaeropbakterilerin büyük çoğunluğunun penisilin, klindamisin, moksifloksasin, metronidazol ve amoksisillin-klavulanik aside karşı bir direnç geliştirdiği veya bu antibiyotiklere karşı artan bir dirence sahip olduğu görülmüştür.Öğe Sarcophaga sp.’nin sebep olduğu nazofarengeal miyaz olgusu(Galenos Yayınevi, 2023) Çiçek, Mutalip; Çakır, Fatih; İpek, Duygu Neval Sayın; Bilden, Alican; Akıl, EşrefMiyazis, Diptera sınıfı larvaların omurgalı doku ve vücut boşluklarını istila etmesi anlamına gelen bir terimdir. Nazal miyaz çoğunlukla Sarcophagidae ve Calliphoridae ailesi üyelerinin neden olduğu bir enfestasyondur. Bulaşında birçok predispozan faktörün rol aldığı hastalığın tedavisinde mekanik temizleme ile beraber antiseptiklerin kullanımı tavsiye edilmektedir. Bu olguda, 75 yaşında yoğun bakımda yatan bir hastada görülen nazofarengeal miyaz sunuldu. Hastanın burnunda dokuz adet larva tespit edilmiştir. Larvalar bölgeden uzaklaştırılarak üç gün boyunca bölge %5’lik iodin solüsyonuyla temizlendi. Makroskobik ve mikroskobik incelemeler sonunda etkenin Sarcophaga sp.’nin üçüncü evre larvaları olduğu belirlendi. Miyaz enfestasyonlarını engellemek için yoğun bakım ünitelerini gibi hastanın bilincinin kapalı olduğu yerlerde görev yapan personeller hastaların burun, ağız ve kulak boşluğu gibi vücut boşluklarını günlük olarak kontrol etmeli, bakım ve temizliğini en uygun şekilde yapmalıdır.Öğe Use of Magnetic Nanoparticles to Isolate Anaerobic Bacteria(Veysi AKPOLAT, 2022) Bilden, Alican; Ertaş, Erdal; Tural, Bilsen; Çakır, Fatih; Atmaca, Selahattin; Tural, ServetObjective: Anaerobic bacteria, which make up an important part of normal body flora, may lead to serious life-threatening infections. Since isolation and identification of anaerobic bacteria require time-consuming, sensitive, and difficult methods, they can only be performed in certain clinical laboratories. For this reason, diagnosis and treatment of anaerobic infections are delayed and drug resistance is observed due to empirical treatment. New methods that will enable the early identification of these bacteria will help reduce the duration of treatment and mortality rates due to anaerobic infections. Method: In this study, it is aimed to design magnetic nanoparticles attached to N-methyl-D-glucamine (Mag-NMDG) to catch anaerobic bacteria for rapid identification. Mag-NMDG nanoparticles were characterized by transmission electron microscopy (TEM), scanning electron microscopy (SEM), dynamic light scattering (DLS), and vibrating sample magnetometer (VSM). Results: Mag-NMDG nanoparticles were applied to gram positive and gram negative anaerobic bacteria such as Actinomyces odontolyticus, Prevotella buccae, Veillonella parvula, Bifidobacterium dentium and Bacteroides fragilis isolated from culture media. The binding of bacteria to Mag-NMDG was determined by microscope images, McFarland values, and MALDI-TOF MS identification scores. Conclusion: As a result of this study, it was concluded that the Mag-NMDG nanoparticles could be used to isolate anaerobic bacteria directly from samples. Thus, it is foreseen that many time-consuming and troublesome steps in the isolation and identification stages can be eliminated.
