Yazar "Akpolat, Nezahat" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 20 / 48
  • Küçük Resim
    Öğe
    2011-2020 yılları arasında Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi’ne başvuran hastalarda bağırsak parazitlerinin dağılımının retrospektif olarak değerlendirilmesi
    (Galenos Yayınevi, 2022) Akpolat, Nezahat; Çakır, Fatih; Çiçek, Mutalip; Bilden, Alican
    Amaç: Bu çalışmada, 2011-2020 yılları arasında Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Parazitoloji Laboratuvarı’na başvuran hastalarda tespit edilen bağırsak parazitlerin dağılımının retrospektif olarak değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Yöntemler: Parazit incelemesi için parazitoloji laboratuvarına gönderilen dışkı numuneleri native-Lugol yöntemi ve selofan bant ile gönderilen numuneler ise direkt mikroskobi ile incelenmiştir. Ayrıca protozoonların tanımlanmasında modifiye asitfast ve trikrom boyama yöntemi kullanılmıştır. Bulgular: Parazitoloji laboratuvarına gönderilen 60,501 Gaita numunesinin %5,99’unda parazit tespit edildi. Bu parazitlerin içerisinde %57,62 ile Blastocystis spp. en yüksek oranda saptandı, bunun dışında saptanan diğer parazitler ise sırasıyla Giardia intestinalis %31,93, Entamoeba histolytica/dispar %3,75, Hymenelopis nana %2,37, Fasciola spp., %1,57, Taenia spp. %0,91, Enterobius vermicularis %0,72, Cryptosporidium spp.%0,52, Cyclospora cayatenensis %0,42, Ascaris lumbricoides ise %0,19 oranında idi. Sonuç: Çalışmamızda bağırsak parazit enfeksiyonlarının görülme oranları on yıllık süre içinde azalma gösterse de önemini korumaya devam etmektedir. Bu nedenle, bağırsak parazitlerinin prevalansının azaltılması için; temiz su kaynaklarının korunması, alt yapı sorunlarının giderilmesi, toplumun sanitasyon kuralları hakkında bilgilendirilmesi gerekmektedir.
  • [ X ]
    Öğe
    2015-2017 YILLARI ARASINDA İZOLE EDİLEN CITROBACTER SUŞLARINDA ANTİBİYOTİK DİRENCİ
    (2017) Akpolat, Nezahat; Yakut, Salim; Atmaca, Selahattin; Özekinci, Tuncer; Gül, Kadri
    .Bu çalışmada Nisan 2015-Mart 2017 tarihleri arasında infeksiyon etkeni olarak izole edilen Citrobacter suşlarının antibiyotik dirençlerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. İzole edilen 72 Citrobacter suşundan 37'si Citrobacter freundii 35'i diğer Citrobacter türleri olarak identifiye edilmiştir. İzole edilen suşların farklı antimikrobiyallere minimum inhibitör konsantrasyon değerleri incelenmiş ve ampisiline % 99, seftazidime % 25, aztreonam ve trimetoprim/sülfametoksazole % 22, siprofloksasine % 15, piperasilin/tazobaktam ve gentamisine % 11, sefepime % 10, meropeneme % 1 ve amikasine % 0 oranlarında direnç saptanmıştır. Amikasin ve meropenem en etkili antibiyotikler olarak bulunmuş, bunları sefepim, gentamisin ve piperasilin/tazobaktam izlenmiştirÇalışmada amikasin ve meropenemin Citrobacter infeksiyonları için iyi bir tedavi alternatifi olduğu sonucuna varılmıştır
  • Küçük Resim
    Öğe
    2015-2017 yılları arasında izole edilen citrobacter suşlarında antibiyotik direnci
    (Antibiyotik ve Kemoterapi Derneği, 2017) Atmaca, Selahattin; Özekinci, Tuncer; Yakut, Salim; Akpolat, Nezahat; Gül, Kadri
    Bu çalışmada Nisan 2015-Mart 2017 tarihleri arasında infeksiyon etkeni olarak izole edilen Citrobacter suşlarının antibiyotik dirençlerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. İzole edilen 72 Citrobacter suşundan 37'si Citrobacter freundii 35'i diğer Citrobacter türleri olarak identifiye edilmiştir. İzole edilen suşların farklı antimikrobiyallere minimum inhibitör konsantrasyon değerleri incelenmiş ve ampisiline % 99, seftazidime % 25, aztreonam ve trimetoprim/sülfametoksazole % 22, siprofloksasine % 15, piperasilin/tazobaktam ve gentamisine % 11, sefepime % 10, meropeneme % 1 ve amikasine % 0 oranlarında direnç saptanmıştır. Amikasin ve meropenem en etkili antibiyotikler olarak bulunmuş, bunları sefepim, gentamisin ve piperasilin/tazobaktam izlenmiştirÇalışmada amikasin ve meropenemin Citrobacter infeksiyonları için iyi bir tedavi alternatifi olduğu sonucuna varılmıştır.
  • [ X ]
    Öğe
    Alveoler ekinokokkozun serolojik tanısında EgHF, Em2 ve EmII/3-10 antijenleri ile hazırlanan ELISA yöntemlerinin tanısal etkinliğinin değerlendirilmesi
    (2014) Akpolat, Nezahat; Altıntaş, Nazmiye; Pektaş, Bayram; Gottsteın, Bruno
    Alveoler ekinokokkoz (AE), insanda Echinococcus multilocularis larvasının neden olduğu ölümcül paraziter hastalıklardan biri olup, özellikle kuzey yarımküredeki birçok ülkede önemli bir halk sağlığı sorunudur. Ülkemizdeki yaşam koşulları ve halkımızın alışkanlıklarıyla parazitin hayat döngüsü arasındaki etkileşim dikkate alındığında, hastalığın bugüne kadar, büyük çoğunluğu Doğu Anadolu bölgesinden bildirilen olgu serilerinden daha yaygın olduğu düşünülmektedir. AE’nin tanısında, dünyada başarıyla kullanılan özgüllüğü yüksek serolojik tanı yöntemlerinin ülkemizde uygulanmıyor olması, radyolo- jik olarak karaciğer lezyonları saptanan hastalarda hatalı malignensi tanılarına yol açmaktadır. Bu çalışmada, AE’nin serolojik tanısında, üç farklı antijen (EgHF, Em2, EmII/3-10) kullanılarak hazırlanan laboratuvar yapımı ELISA testlerinin tanısal etkinliklerinin araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmamızda, testlerin duyarlılık ve özgüllüğünü değerlendirmek amacıyla, Bern Üniversitesi Parazitoloji Enstitüsünden sağlanan, tamamı klinik ve parazitolojik ve/veya histopatolojik olarak doğrulanmış, 10 farklı helmint ile enfekte (E.multilocularis, E.granulosus, Taenia solium, Wuchereria bancrofti, Strongyloides stercolaris, Ascaris lumbricoides, Toxocara canis, Trichinella spiralis, Fasciola hepatica, Schistosoma haematobium) 10’ar hasta olmak üzere toplam 100 hastadan alınan serum örnekleri kullanılmıştır. Antijen olarak kullanılan EgHF (E.granulosus hydatid fluid antigen) laboratuvarımızda kistik ekinokokkozlu koyun karaciğer kist sıvılarından hazırlanmış; Em2 (E.multilocularis metacestode-purified laminated layer antigen) ve EmII/3-10 (E.multilocularis recombinant protoscolex tegument antigen) ise Bern Üniversitesi Parazitoloji Enstitüsünden sağlanmıştır. Düz tabanlı ELISA plakları; çukur başına antijen konsantrasyonu EgHF, Em2 ve EmII/3-10 için sırasıyla 2.5 ?g, 1 ?g ve 0.18 ?g olacak şekilde kaplanmış ve EgHF-ELISA, Em2-ELISA ve EmII/3-10-ELISA yöntemleri tüm serumlara uygulanmıştır. Her üç test için belirlenen eşik değerinin (negatif kontrollerin OD ortalaması+2 SD) üstünde reaksiyon veren örnekler pozitif kabul edilmiştir. Çalışmada, EgHF, Em2 ve Em2II/3-10 antijenleri ile uygulanan ELISA yöntemlerinin duyarlılık değerleri sırasıyla %100, %90 ve %90; özgüllük değerleri ise sırasıyla %63, %91 ve %91 olarak hesaplanmıştır. Em2-ELISA ve EmII/3-10- ELISA ile saptanan pozitiflikler birlikte değerlendirildiğinde ise özgüllüğün %96’ya yükseldiği izlenmiştir. Bu verilere göre, AE’nin serolojik tanısı için üç farklı antijenin kullanıldığı ELISA testlerinin birlikte uygulanması halinde, yüksek duyarlılık (EgHF-ELISA ile %100) ve özgüllüğün (Em2-ELISA + EmII/3-10- ELISA ile %96) sağlanacağı görülmektedir. Sonuç olarak, AE açısından endemik olan ülkemizde, büyük ölçüde görüntüleme yöntemleriyle tanımlanan AE’nin erken ve doğru tanısında, Em2-ELISA ve EmII/3- 10-ELISA gibi özgüllüğü yüksek serolojik yöntemlerin güvenle kullanılabileceği ve radyolojik verilere önemli katkıda bulunacağı kanısına varılmıştır.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Assessment of the results of erlich ziehlneelsen and fluorochrome staining procedures, bactec 460 and löwenstein-jensen culturing procedures in the diagnosis of tuberculosis
    (2004) Mete, Mahmut; Özekinci, Tuncer; Suay, Adnan; Akpolat, Nezahat; Atmaca, Selahattin
    The Ziehl-Neelsen (ZN) and fluorochrome (FC) staining procedures and the Bactec and Löwenstein-Jensen (L-J) culturing procedures were used to test 340 clinical specimens for tuberculosis, and the diagnostic value of the fluorochrome procedure was investigated. Positive cultures were obtained from 34 specimens (10%), of which 13 (3.8%) tested positive in ZN, and 18 (5.3%) in FC. Sensitivity of the ZN and FC staining results was found to be 38.2% and 52.9%, respectively. NAP (p-nitro-?-acetylamino-?-hidroxypropiophenone) identified 32 (94.1%) of the 34 strains as M. tuberculosis complex, and 2 (5.9%) as Mycobacteria other than tuberculosis (MOTT) bacilli. Twenty-one (61.7%) of the 34 culture-positive specimens grew only in Bactec 12 B medium, 2 (5.9%) grew only in L-J medium, and 11 (32.3%) grew in both Bactec and L-J media. The 32 M. tuberculosis complex strains' sensitivities to streptomycin (STR), isoniazid (INH), rifampin (RIF), and ethambutol were assessed with the Bactec system. Four (12.5%) of these strains were resistant to streptomycin, 9 (28.1%) to isoniazid, 7 (21.8%) to rifampin, and 6 (18.7%) to ethambutol. Total drug resistance was 43.7%. Six strains (18.7%) were resistant to 1 drug, 5 (15.6%) to 2 drugs, 2 (6.2%) to 3 drugs, and 1 (3.1%) to all 4 drugs, isoniazid plus rifampin resistance was seen in 18.7%.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Bir üniversite hastanesi’nde bildirimi zorunlu bulaşıcı hastalık bildirimleri ile ilgili hekimlerin bilgi düzeyleri
    (Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi, 2014) Korkmaz, Mustafa; Uysal, Cem; Durmaz, Ubeydullah; Ezin, Özgür; Deveci, Özcan; İpek, Davut; Palanci, Yılmaz; Akpolat, Nezahat
    Amaç: Bu çalışmamızda hastanemiz de çeşitli servislerde çalışan hekimlerin bildirimi zorunlu bulaşıcı hastalıklar (BZBH)’ lar hakkındaki bilgi düzeylerinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Yöntemler: Çalışmamız bir anket çalışması olup, 2015 yılında Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanelerinde akademik personel ve asistan doktorlardan oluşan 105 kişiye gönüllülük esasına bağlı olarak uygulanmıştır. Bulgular: Çalışmamıza katılan 105 gönüllü hekimin 77 (%73,3) tanesi erkek olup 28 (%26,7) tanesi kadındı. Hekimler yaş aralıklarına göre değerlendirildiğinde 24-30 yaş aralığında 63 (%60), 31- 35 yaş aralığında 21 (%20 ), 36-40 yaş aralığında 14 (%13,3), 41 yaş ve üzerinde ise toplam 7 (%6,7) hekim bulunmakta idi. Hekimlerin 90 (%85,7)’ ının BZBH’ lar hakkında kendini bilgi yönünden yetersiz hissettiğini tespit ettik. Araştırmamızda yaş grubu, cinsiyet, unvan ve hekimlik süresi ile bilgi düzeyi arasında anlamlı istatistiksel bir fark saptanmadı (p>0,05). Çalışmamızda hekimlerin çalıştıkları birimlere göre bilgi düzeyleri karşılaştırıldığında Enfeksiyon Hastalıkları, Tıbbi Mikrobiyoloji, Göğüs Hastalıkları ve Halk Sağlığı Anabilim Dalı gibi BZBH’ lar konusunda hizmet içi eğitim alan birimlerde BZBH’ lar hakkındaki bilgilerinin diğer birimlerle karşılaştırılmasında istatistiksel olarak anlamlı fark bulundu (p<0,05). Sonuç: Daha uzun meslek deneyimi, unvan, yaş ve cinsiyet faktörlerinin BZBH’ lar hakkında bilgi düzeyinde etkili olmadığı ancak bu konu ile ilgilenen ve hizmet içi eğitim alan bölümlerde BZBH’ lar hakkında bilgi düzeyinin yüksek bulunması bunun eğitimle ilişkili olduğunu desteklemektedir. Hekimlerin işe giriş oryantasyon eğitimi konuları içinde ve hizmet içi alınan eğitimlerde BZBH ‘ ların öncelikli konular arasında yer alması yararlı olacaktır.
  • [ X ]
    Öğe
    Brucellosis seroprevalence in southeast Turkey (Diyarbakır)
    (2004) Atmaca, Selahattin; Elçi, Saffet; Özekinci, Tuncer; Suay, Adnan; Arıkan, Eralp; Akpolat, Nezahat
    This study was conducted to determine brucellosis seropositivity in patients suspected of having brucellosis who sought treatment at the Central Laboratory of Dicle University Medical Faculty Hospital in southeast Turkey (Diyarbakır). 20,663 serum samples were collected during the study (1 August 2001-31 December 2002), and 14,480 sera were tested in a 12-month period on a seasonal basis by Rose-Bengal slide agglutination (RBSA), and positive sera were titrated by standard tube agglutination (STA). Titration values of 1/160 and above were considered positive. Of the 20663 sera, 463 (2.2%) tested positive on RBSA. Of these 463 sera, 267 (57.6%) tested positive on STA, with titers of 1/160 and higher. Seasonally, hospital attendance was highest in the summer and lowest in the winter. On STA tests done on RBSA-positive samples, the highest concentration of titers of 1/160+ was in the spring. In order to eliminate brucellosis in southeast Turkey, an endemic region for the disease, precautions must be increased, the unregulated slaughtering and consumption of animals must be prevented, and the consumption of raw, unpasteurized milk and of dairy products made from such milk must be halted.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Comparision of bactericidal activity of microwave, ultraviolet and disinfectant solutions on some bacterial strains
    (2004) Akşen, Feyzan; Kaya, Abdurrahman; Akpolat, Nezahat
    In this study, bactericidal activity of microwave, ultraviolet (UV) and some of disinfectant solutions such as 1% Setridif and 2% Lysoformin and salina solution were investigated. Some bacterial strains such as Proteus vulgaris (6/10/225 RSKK), Bacillus cereus (RSKK 5127), Staphylococcus aureus (RSKK 395), Esc-herichia coli (MI. 205), Pseudomonas aeruginosa and Listeria monocytogenes were selected for this purpose. One minutes of microwave exposure was enough to destruct all the bacterial strains used in this study except B. cereus. We observed that 5 minutes of microwave exposure was not enough for destruction of B. cereus. However, any of B. cereus was not observed for 10 minutes of microwave exposure. On the other hand, three minutes of UV exposure was found enough for destruction of S. aerus and P. aeruginosa. 5 minutes of UV exposure was found necessary for destruction of P. vulgaris and L. monocytogenes. However, we observed that at least 10 minutes of UV exposure was necessary to destruct E. coli and B. cereus. 30, 45 and 60 minutes of salina treatment was not observed as destructive agent for bacterial strains under investigation. 30 minutes of setridif and lysoformin treatment was found enough for destruction of E. coli, S. aureus and L. monocytogenes. 30, 45 and 60 minutes of setridif treatment was not found enough for destruction of P. vulgaris and B. cereus while 30 minutes of lysoformin was found enough for bactericidal activity. 45 minutes of setridif was enough for destruction of P. aeruginosa while 30, 45 and 60 minutes of lysoformin was not enough for bactericidal activity of same bacteria. In conclusion, these findings emphasize the need for caution in selecting an appropriate disinfectant or physical agents such as microwave and UV to use on contaminated surfaces.
  • [ X ]
    Öğe
    Cryptococcus liquefaciens meningitis in a patient with T cell non Hodgin lymphoma
    (Edizioni Minerva Medica, 2019) Ozcan, Nida; Dal, Tuba; Akpolat, Nezahat; Durmaz, Riza; Yakut, Salim; Zeybek, Hasan; Gul, Kadri
    Invasive fungal cryptococcosis including meningitidis is a growing threat to immunocompromised patients. Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii are the main agents of human cryptococcosis. In recent years, there has been an increased incidence of opportunistic infections caused by other species, such as C. liquefaciens. In this study, we presented a meningitis case report caused by Cryptococcus liquefaciens in a 12 years old girl with T cell NHL (Non Hodgin lymphoma). A 12-year-old female patient with a diagnosis of T-NHL (T cell Non-Hodgkin's lymphoma) under the chemotherapy was hospitalized in Hematology Clinic with the complaints of fever and occasional headache for three days. The yeast colonies were isolated from cerebrospinal fluid material (CSF). MALDI-TOF MS (Matriks assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry, Bruker Daltonics, USA) and Nested PCR (polymerase chain reaction) were used to identify the yeast. Isolated yeast is identified as Cryptococcus liquefaciens by MALDI-TOF MS and Nested PCR. In conclusion, C. liquefaciens can be a causative agent of menigitidis in cases with NHL. Nested PCR was a good, time-saving and economical method for the accurate and early diagnosis of C. liquefaciens infections. Our presented case also showed that result of MALDI-TOF method was compatible with nested PCR method in identification of C. liquefaciens.
  • [ X ]
    Öğe
    Dissemination of blaOXA-48 like, blaNDM, blaKPC, blaIMP-1, blaVIM genes among carbapenem-resistant Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae strains in Southeastern Turkey: first report of Klebsiella pneumoniae co-producing blaOXA-48-like, blaVIM and blaIMP-1 genes
    (Lippincott Williams & Wilkins, 2021) Bilik, Ozge Alkan; Bayraktar, Mehmet; Ozcan, Nida; Gul, Kadri; Akpolat, Nezahat
    Introduction: Carbapenem-resistant Enterobacterales (CRE) cause serious and life-threatening infections with limited treatment options. The most common causes of carbapenem resistance are carbapenemases. We aimed to determine the most prevalent carbapenemase genes; bla(NDM), bla(KPC), bla(IMP-1), bla(VIM), bla(OXA-48) like genes among Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli strains in the southeast region of Turkey. Methods: Eighty-nine isolates (74 K. pneumoniae, 15 E. coli) were included in the study. The isolates were found as carbapenem-resistant by BD Phoenix automated system and Kirby Bauer disk diffusion test. Antibiotic susceptibility testing was performed by BD Phoenix automated system. Combination disc method (CDM) was also carried out as phenotypic method of carbapenemase detection. The presence of bla(NDM), bla(KPC), bla(IMP-1), bla(VIM) and bla(OXA-48)-like genes were investigated by Xpert CARBA-R (Cepheid, USA) multiplex PCR commercial system. Results: Antibiotic resistance rates by Phoenix were 48.3 97.8, 80.9, 96.6, 93.3, 96.6, 97.8, 69.7 and 97.8% for amikacin, aztreonam, cefepime, ceftazidime, ciprofloxacin, levofloxacin, moxifloxacin, trimethoprim sulfamethoxazole and piperacillin-tazobactam, respectively. The bla(OXA-48)-like gene was detected in 65 (73%); bla(NDM) gene in 4 (4.5%); co-production of bla(OXA-48)-like and bla(NDM) in 6 (6.7%); co-production of bla(OXA-48)-like, bla(VIM) and bla(IMP-1) genes in 1(1.2%) isolate. None of the bla(OXA-48)-like, bla(NDM), bla(VIM), bla(IMP-1), bla(KPC) genes were detected in 13 (14.6%) of the isolates. The sensitivity and specificity of CDM were calculated as 80 and 85% respectively. Conclusion: We detected bla(OXA-48)-like gene most frequently in our region. To our knowledge, this is the first report of K. pneumoniae-co-producing bla(OXA-48)-like, bla(VIM) and bla(IMP-1) genes. The coexistence of these genes is alarming and causes both infection control and treatment problems. Effective infection control measures are essential to prevent the spread of antibiotic resistance. Copyright (C) 2021 Wolters Kluwer Health, Inc. All rights reserved.
  • [ X ]
    Öğe
    Diyarbakır Dicle ilçesi Dedeköy ve Durabeyli'de kutanöz leishmaniasis olgularının incelenmesi
    (2004) Ertem, Melikşah; Acemoğlu, Hamit; Aytekin, Nevzat; Aytekin, Sema; Akpolat, Nezahat
    Dicle Üniversitesi Hastanesi Dermatoloji Anabilim Dalı'na 2001 yılında çoğunluğu Diyarbakır'ın Kuzeydoğusunda bulunan iki köy olan Durabeyli ve Dedeköy'den gelen kutanöz leishmaniasis olgularında saptanan artış salgın olarak yorumlanmış ve olguların değerlendirilmesi amacıyla iki aşamada gerçekleştirilen bu çalışma planlanmıştır. Bu köylerde anonsla, muayeneye gelen 78 kişinin lezyonundan alman örneklerde giemsa boyama ile parazitolojik inceleme yapılmış, ayrıca olası diğer olguları saptamak amacıyla bu köylerde yaşayanlardan 443'ü dermatolojik olarak muayene edilmiştir. Alınan 78 örnekten yapılan Giemsa boyalı preparatların 20'sinde (%25.6) Leishmania amastigotları görülmüştür. Köylerde yapılan incelemelerde 443 kişinin 101'inde (%22.79) skar yada lezyon saptanmıştır. Bu 101 kişinin 44'ünde skar, 57'sinde lezyon olduğu, ilk olguların ise 30 ay önce başladığı ve giderek sayıda artma olduğu tesbit edilmiştir. Bu salgının bireylerin yaşama koşullarından, GAP sulama ve tarım projesinden kaynaklanabileceğini akla getirmiştir. Ancak elimizdeki veriler görülen salgını sulu tarıma bağlamaya yetecek düzeyde değildir. Çalışmamızdan 30 ay önce ilk çıkan olguların çok azına tedavi uygulanmıştır. Bu salgında tedavi edilmemiş olguların varlığı etkili olabileceği düşünülmüştür. Köylerden KL'in endemik olduğu Şanlıurfa gibi bir ile mevsimlik işçi olarak gitmediği belirlenmiştir.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Ekstraintestinal patojenik Escherichia coli: Virülans faktörleri
    (Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti, 2023) Akdoğan, Hüseyin; Akpolat, Nezahat
    Escherichia coli insanlarda hem mikrobiyota hem de patojenite açısından en önemli bakterilerden biridir. E. coli ekstraintestinal ve intestinal gruplarda yer alan farklı patolojik etkiler gösteren farklı patotiplere sahiptir. Ekstraintestinal E. coli grubunda üropatojenik E. coli, sepsis ilişkili E. coli ve neonatal menenjit ilişki E. coli yer almaktadır. Bunlar arasında en sık enfeksiyon etkeni üropatojenik E. coli’dir. Farklı patolojik etkilere sahip enfeksiyonlara neden olması ekstraintestinal E. coli’de çeşitli virülans faktörlerinin varlığına bağlıdır. Bu faktörler arasında başlıca adezinler, invazinler, sideroforlar, protektinler/serum direnci ve toksinler yer almaktadır. Bu derlemede ekstraintestinal patojenik E.coli enfeksiyonlarının patogenezinde rol alan bu virülans faktörleri ele alınmıştır.
  • [ X ]
    Öğe
    Evaluation of the Diagnostic Value of the ELISA Tests Developed by Using EgHF, Em2 and EmII/3-10 Antigens in the Serological Diagnosis of Alveolar Echinococcosis
    (Ankara Microbiology Soc, 2014) Pektas, Bayram; Altintas, Nazmiye; Akpolat, Nezahat; Gottstein, Bruno
    Alveolar echinococcosis (AE), caused by larva stage of Echinococcus multilocularis, is one of the lethal parasitic diseases of man and a major public health problem in many countries in the northern hemisphere. When the living conditions and habits in Turkey were considered in terms of relation with the life cycle of the parasite, it was suggested that AE has been much more common than reported mainly from the Eastern Anatolia region of Turkey. Since in vitro serologic diagnosis tests with high specificity for AE have not been used in our country, most of the cases with liver lesions were misdiagnosed by radiological investigations as malignancies. The aim of this study was to evaluate the diagnostic value of the in-house ELISA methods developed by using three different antigens (EgHF, Em2, EmII/3-10) in the serological diagnosis of AE. The study samples included a total of 100 sera provided by Bern University Parasitology Institute where samples were obtained from patients with helminthiasis and all were confirmed by clinical, parasitological and/or histopathological means. Ten samples from each of the cases infected by E.multilocularis, E.granulosus, Taenia solium, Wuchereria bancrofti, Strongyloides stercolaris, Ascaris lumbricoides, Toxocara canis, Trichinella spiralis. Fasciola hepatica and Schistosoma haematobium were studied. In the study, EgHF (E.granulosus hydatid fluid) antigens were prepared in our laboratory from the liver cyst fluids of sheeps with cystic echinococcosis, however Em2 (E.multilocularis metacestode-purified laminated layer) and EmII/3-10 (E.multilocularis recombinant protoscolex tegument) antigens were provided by Bern University Parasitology Institute. Flat bottom ELISA plates were covered with EgHF, Em2 and EmII/3-10 antigens in the concentrations of 2.5 mu g, 1 mu g and 0.18 mu g per well, respectively, and all sera were tested by EgHF-ELISA, Em2-ELISA and EmII/3-10-ELISA methods. For each tests, the samples which were reactive above the cut-off value (mean OD of negative controls+2 SD) were accepted as positive. The sensitivity of the ELISA tests performed with EgHF, Em2 and Em2II/3-10 antigens were estimated as 100%, 90% and 90%, respectively, whereas the specificity were 63%, 91% and 91%, respectively. When Em2-ELISA and EmII/3-10-ELISA tests were evaluated together, the specificity increased to 96%. Our data indicated that the highest sensitivity (100% with EgHF-ELISA) and specificity (96% with Em2-ELISA + EmII/3-10-ELISA) for the serodiagnosis of AE can be achieved by the combined use of the ELISA tests with three different antigens. It was concluded that the early and accurate diagnosis of AE in our country which is endemic for that disease, could be supported by the use of highly specific serological tests such as Em2-ELISA ve EmII/3-10-ELISA contributing radiological data.
  • [ X ]
    Öğe
    Evaluation of the Ehrlich-Ziehi-Neelsen (EZN) and Amplified Mycobacterium tuberculosis Direct Test according to the BACTEC method in respiratory and nonrespiratory samples
    (Tubitak Scientific & Technological Research Council Turkey, 2007) Ozekinci, Tuncer; Mese, Sevinn; Atmaca, Selahattin; Akpolat, Nezahat; Guel, Kadri
    Aim: Tuberculosis remains a significant and threatening disease, particularly in developing countries. Mycobacterium tuberculosis should be detected and identified as soon as possible to ensure the prevention of the spread of the disease. For this purpose, use of fast and reliable laboratory diagnostic methods with high sensitivity and specificity was initiated in recent years. Materials and Methods: In this study, 107 respiratory and 198 norrespiratory (305 in total) samples submitted to Dicle University Faculty of Medicine Clinical Microbiology Laboratory were examined using the Ehrlich-Ziehl-Neelsen (EZN), BACTEC 460 TB (Becton and Dickinson Diagnostic Instrument System, Towson, MID), and MTD (Amplified Mycobacterium tuberculosis Direct Test, Gen-Probe, USA) methods. Results: In respiratory samples, sensitivity of EZN was found as 83.33%, specificity as 95.04%, positive predictive value as 50%, and negative predictive value as 98.96%, whereas in nonrespiratory samples these values were 18.18%, 98.39%, 40%, and 95.37%, respectively. In respiratory samples, sensitivity of MTD was found as 83.33%, specificity as 94.05%, positive predictive value as 45.45%, and negative predictive value as 98.95%, whereas in nonrespiratory samples these values were 54.54%, 88.23%, 21.42%, and 97.05%, respectively. Conclusions: In view of the above, the pre-diagnostic EZN test and the MTD method based on nucleic acid amplification should be applied together with the BACTEC 460 system, which is considered as a gold standard, and the evaluation should be made accordingly. Furthermore, MTD should not be used as a screening test due to its high cost, and should rather be preferred in smear-positive samples.
  • [ X ]
    Öğe
    Evaluation of the ehrlich-ziehl-neelsen (EZN) and amplified mycobacterium tuberculosis direct test according to the bacted method in respiratory and nonrespiratory samples
    (2007) Gül, Kadri; Özekinci, Tuncer; Atmaca, Selahattin; Meşe, Sevim; Akpolat, Nezahat
    Amaç: Tüberküloz özellikle gelişmekte olan ülkelerde önemli ve tehdit edici bir hastalık olarak varlığını sürdürmektedir. Hastalığın yayılımının önlenmesi bakımından Mycobacterium tuberculosis'm tespiti ve identifikasyonunun mümkün olan en kısa sürede yapılması gerekmektedir. Bu amaçla son yıllarda duyarlılık ve özgüllüğü yüksek, güvenilir, hızlı laboratuvar tanı yöntemleri kullanılmaya bağlanmıştır. Yöntemler: Bu çalışmada Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Klinik Mikrobiyoloji Laboratuvarf na gönderilen 107 respiratuar ve 198 nonrespiratuar olmak üzere toplam 305 örnek Ehrlich- Ziehl-Neelsen (EZN), BACTEC 460 TB (Becton and Dickinson Diagnostik İnsturment Sistem, Towson, MD), MTD (Amplified Mycobacterium tuberculosis Direct Test, Gen-Probe, ABD) yöntemleri ile incelenmiştir. Bulgular: EZN için respiratuar örneklerde duyarlılık %83.33, özgüllük %95.04, pozitif prediktif değer %50, negatif prediktif değer %98.96, nonrespiratuar örneklerde ise bu değerler sırasıyla %18.18, %98.39, %40, %95.37 MTD için respiratuar örneklerde duyarlılık %83.33, özgüllük %94.05, pozitif prediktif değer %45.45, negatif prediktif değer %98.95, nonrespiratuar örneklerde ise bu değerler sırasıyla %54.54, %88.23, %21.42, %97.05 olarak bulunmuştur. Sonuç: Ön tanı testi olan EZN ve nükleik asit amplifikasyon esasına dayanan MTD yöntemlerinin, altın standart olarak kabul edilen BACTEC TB 460 sistemiyle birlikte çalışılması ve değerlendirmelerin buna göre yapılması gerekmektedir. Ayrıca pahalı olması nedeni ile MTD, tarama testi olarak kullanılmamalı, daha çok smear pozitif örneklerde kullanılmaları tercih edilmelidir.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Evaluation of the seroprevalence and the demographic and clinical findings of fascioliasis patients in the Dicle River Basin in Turkey: a nine-year experience at a university hospital
    (Verduci Publisher, 2023) Çiçek, Mutalip; Yalçın, Kendal; Bilden, Alican; Çakır, Fatih; Akpolat, Nezahat
    OBJECTIVE: Fasciola hepati-ca and Fasciola gigantica are liver trematodes that cause fascioliasis in humans and animals. In Turkey, the medical importance of fascioliasis has been increasing in humans, and it continues to cause great economic loss in the field of an -imal husbandry. Therefore, it is important to di-agnose fascioliasis quickly and reliably. The aim of this study is to show that the ELISA test is a reliable and specific method for diagnosing fas-cioliasis both in the early stage and in the acute stage.PATIENTS AND METHODS: In this study, 640 individuals aged 7-75 years who showed one or more symptoms of fascioliasis, such as abdom-inal pain, fever, weight loss, weakness, fatigue, headache, sweating, nausea, vomiting, allergic urticaria, liver mass, hypereosinophilia, or liver enzyme elevation, were recruited from the Dicle University Research and Application Hospital in southeastern Turkey. Serum and fecal samples were taken from them to investigate if the Fas-ciola hepatica IgG antibody was present in the serum and if eggs were present in the feces. To detect the IgG antibodies, an enzyme-linked im-munosorbent assay (ELISA) kit was used. The stool samples were analyzed for three consec-utive days in mini Parasep fecal parasite con-centrator tubes using the native-lugol and sed-imentation methods. Abdominal ultrasonogra-phy and computed tomography were performed in all the patients.RESULTS: Among the subjects of this study, 90 (14%) were positive for fascioliasis, of whom 85 (94.4%) were adults and 5 (5.5%), children; 73 (81.1%) were women and 17 (18.8%), men; 57 (63.3%) lived in the rural areas and 33 (36.6%), in the city center; 90 (14%) were positive for Fasci-ola hepatica IgG antibodies; (20%) had helminth eggs in their stools; and 85 (94.4%) had a histo-ry of eating watercress.CONCLUSIONS: According to the epidemio-logical classification for fascioliasis by Mas -Co-ma, the Dicle Basin, which is the setting of this study, is indeed a hyperendemic region. Thus, ELISA is a reliable and specific method of diag-nosing fascioliasis, both in the early phase and in the acute phase, when the eggs are no longer seen in the stool.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Gözler açık/kapalı durumunda EEG bantlarındaki frekans değişiminin güç spektral yoğunluğu ile belirlenmesi
    (Dicle Üniversitesi Mühendislik Fakültesi, 2015) Türk, Ömer; Özerdem, Mehmet Siraç; Akpolat, Nezahat
    Elektroensefalogram (EEG) işareti, beyindeki elektriksel aktivite hakkında bilgi edinmek amacıyla yaygın olarak kullanılmaktadır. Bu çalışmada, gözün açık ve kapalı durumunda EEG de görülen değişimin güç spektral yoğunluğu (GSY) incelenmiş olup, frekans değişiminin hangi aralıkta etkin olduğu farklı yaklaşımlar ile kabaca belirlenmiştir. Belirlenme sürecinde dalgacık yöntemi (DD) kullanılarak, işaret alt bandlarına ayrıştırılmıştır. GSY tahmini için klasik yöntemlerden Welch metodu ile işaret modelleme sürecini kullanan parametrik yöntemlerden Burg ve Yule-Walker yöntemleri kullanılmıştır. Gözler açık durumuna göre gözler kapalı iken EEG’de alfa ritminde yer alan frekansların baskın olduğu görülmüştür. Güç spektral yoğunluk hesabında, parametrik yöntemler ile işaretlerdeki var olan farklılıkların daha belirgin görülebilmesine olanak sağladığı görülmüştür
  • [ X ]
    Öğe
    Güneydoğu Anadolu Bölgesi'nde Rutin Hepatit B Aşı Programının Etkisi
    (2017) Gül, Kadri; Özekinci, Tuncer; Atmaca, Selahattin; Akpolat, Nezahat
    Diyarbakır Türkiye'nin Güneydoğu Anadolu Bölgesi'ndeki en büyük ve önemli yerleşim alanlarından biridir. 1998 yılında Sağlık Bakanlığı tarafından düzenli olarak HBV aşısı uygulanmaya başlanmıştır. Bu çalışmanın amacı, 2017 yılında HBV'li hastalarda HBV DNA düzeylerini saptamak, 2002 ve 2012 yılı sonuçları ile yaş gruplarına göre karşılaştırmaktır. Hastaların HBV DNA sonuçları yedi yaş grubuna ayrılmış (0-14, 15-20, 21-30, 31-40, 41-50, 51-60, >61), 2002 ve 2012 düzeyleri ile karşılaştırılmıştır. 0-14 yaş grubunda 2017 yılında 2002 ve 2012'ye göre istatiksel olarak anlamlı bir azalma olduğu gösterilmiştir. Çalışmamız, rutin HBV aşı programının bölgede HBV enfeksiyonu riskinde özellikle 0-14 yaş grubunda yıllar içinde istatiksel olarak anlamlı bir azalma sağladığını göstermektedir.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Güneydoğu Anadolu Bölgesi’nde rutin Hepatit B aşı programının etkisi
    (Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi, 2017) Özekinci, Tuncer; Atmaca, Selahattin; Akpolat, Nezahat; Gül, Kadri
    Diyarbakır Türkiye’nin Güneydoğu Anadolu Bölgesi’ndeki en büyük ve önemli yerleşim alanlarından biridir. 1998 yılında Sağlık Bakanlığı tarafından düzenli olarak HBV aşısı uygulanmaya başlanmıştır. Bu çalışmanın amacı, 2017 yılında HBV’li hastalarda HBV DNA düzeylerini saptamak, 2002 ve 2012 yılı sonuçları ile yaş gruplarına göre karşılaştırmaktır. Hastaların HBV DNA sonuçları yedi yaş grubuna ayrılmış (0-14, 15-20, 21-30, 31-40, 41-50, 51-60, >61), 2002 ve 2012 düzeyleri ile karşılaştırılmıştır. 0-14 yaş grubunda 2017 yılında 2002 ve 2012’ye göre istatiksel olarak anlamlı bir azalma olduğu gösterilmiştir. Çalışmamız, rutin HBV aşı programının bölgede HBV enfeksiyonu riskinde özellikle 0-14 yaş grubunda yıllar içinde istatiksel olarak anlamlı bir azalma sağladığını göstermektedir.
  • [ X ]
    Öğe
    The Importance of Indirect Fluoresan Antibody Test in the Diagnosis of Cystic Echinococcosis
    (Ortadogu Ad Pres & Publ Co, 2009) Akpolat, Nezahat; Gedik, Ercan
    Objective: Cystic echinococcosis (CE) is a widespread human infection caused by the larval stage of the taeniid tapeworm Echinococcus granulosus. The disease is well known in sheep-herding areas of Asia, Africa and South Central America. This parasitic infection is relatively frequent around the Mediterranean Sea. The clinical features are non-specific. Many serologic techniques can be used to detect or quantify humoral immunity. Their sensitivity and specificity, depending on the quality of antigens, are well known. The aim of this study was to evaluate the utility of indirect immunofluorescent-antibody assay in the diagnosis of CE. Material and Methods: This study was conducted in the Microbiology Department of the Dicle University Medical Faculty and Genaral Surgical Unit of the same hospital between May 2006 and June 2008. In this study, we evaluated the serum samples of 54 non-GE patients and 77 serum samples of patients with a clinical and radiological diagnosis of CE and who were operated later. The specific IgG antibody was investigated in 131 serum samples by indirect immunofluorescent-antibody assay. The study was performed by Anti-Echinococcus granulosus IIFT commercial kit using the frozen sections of Echinoccocus larvae. Results: E. granulosus IgG antibodies were investigated in 131 serum samples. Of the samples, 81 (61.83%) were seropositive and 50 (38.16%) were seronegative. Among 81 serum samples which were serologically positive, 70 (86.41%) were from patients with a radiological and clinical diagnosis of CE and 11 (13.58%) were from patients without a previous diagnosis. Seven seronegative samples were from CE patients. The mean age of the patients was 35.78 (8-83) and of the 77 CE patients, 55 (71.42%) were female, 22 (28.57%) were male; the infection was localized in the liver in 93.5% of the cases. The sensitivity and the specificity of the IFA were 91.6% and 83.0% respectively. The positive and negative predictive values of the test were 87% and 88.5%, respectively. Conclusion: Indirect immunofluorescent-antibody assay is a sensitive and specific test, especially in liver-localized CE. The assay is easy to run and provides an advantage of rapid diagnosis. The test may be used confidently along with radiological diagnostic methods.