Effect of initial configuration on DFT calculations for transition metal complexes

Basit Öğe Kaydı
dc.authorid0000-0002-2488-0378en_US
dc.authorid0000-0002-1018-5438en_US
dc.authorid0000-0002-4238-5012en_US
dc.authorid0000-0003-0899-1948en_US
dc.authorid0000-0003-0456-5124en_US
dc.authorid0000-0001-5700-8546en_US
dc.authorid0000-0003-0142-9215en_US
dc.contributor.authorBinbay, Nil E.
dc.contributor.authorBinbay, Veysel
dc.contributor.authorAydemir, Murat
dc.contributor.authorDurap, Feyyaz
dc.contributor.authorMeriç, Nermin
dc.contributor.authorKayan, Cezmi
dc.contributor.authorArslan, Nevin
dc.date.accessioned2023-07-05T10:40:54Z
dc.date.available2023-07-05T10:40:54Z
dc.date.issued2019en_US
dc.departmentDicle Üniversitesi, Diyarbakır Teknik Bilimler Meslek Yüksekokulu, Elektronik ve Otomasyon Bölümüen_US
dc.description.abstractComputational methods, which solves the Schrödinger’s equation for molecules, have become an indispensable tool in last decades.And Density Functional Theory is one of the most used, and most effective computational method.Transition Metal complexes, on the other hand, have been being used extensively in many important applications in many fields, suchas chemical catalysts, atomic thin films, and pharmaceutical industry. Applying computational methods to transition metal complexeshas become inevitable to understand better, to control and to design these compounds.As it is known, it is very difficult to handle transition metals computationally, mostly due to near degeneracy in their electronic states.The computational algorithms usually cannot achieve as successive result as they can do for other typical elements, like carbon ornitrogen for instance. Computational methods are needed to be improved for properly deal with transition metal complexes. To findcomputationally cheaper but still effective methods to deal with these complexes is a major challenge.Unlike the analogue calculations, computational methods solve all equations iteratively, so there are major differences between thesetwo calculation types. The starting point in state space (the assumed initial conformation of molecule) is could have a stronger effectthen the expected, on the flow of the iterative solving algorithm of the computational approach.Here we present a comparative study for a Ruthenium complex. We have optimised the molecule several times. Each of the optimisationsstarted from different initial molecular conformations. Then we have compared the result in different ways, like calculation times andminimum energy that had reached, to see effect of starting configurations on the calculation.It is showed that, starting configuration is an important parameter for computational calculations of transition metal complexes, and itis needed to be carefully chosen to improve success of calculations.en_US
dc.description.abstractMoleküller için Schrödinger denklemini çözen hesaplamalı kimya metodları, son yıllarda gözardı edilemez araçlar haline gelmiştir. Density Functional Theory (DFT) de bu metodlar arasında en etkili olup, en çok kullanılanlardan biri olagelmiştir. Geçiş metalleri, öte yandan, kimyasal katalizörler, atomic ince film üretimi, ilaç endüstrisi gibi sayılabilecek pek çok alanda önemli uygulamalarda artan bir yoğunlukta kullanılagelmiştir. Bu çerçevede hesaplamalı kimya araçlarının geçiş metalleri için uygulanması, bu bileşikleri deha iyi anlamak, control etmek ve tasarlamak için kaçınılmaz hale gelmiştir. Bilindiği üzere geçiş metallerini hesaplamalı araçlarla ele almak, sahip oldukları dejenere kuantum durumları nedeniyle, oldukça zordur. Bu nedenle hesaplamalı kuantum kimya algoritmaları, diğer elementlerin bileşikleri için elde ettikleri başarıyı, geçiş metalleri için de en azından aynı kolaylıkla elde edemezler. Bu nedenle hesaplama araçlarının, geçiş metallerini daha kolay ele alabilecek şekilde geliştirilmesine ihtiyaç duyulmaktadır. Geçiş metallerini ele almak üzere, daha az hesaplama kaynağı gerektiren ama öte yandan daha efektif yöntemler bulmak, günümüz araştırmacılarının yoğun olarak uğraştığı konulardan biridir. Analog çözümlerden farklı olarak, nümerik yaklaşımlar denklemleri iteratif yollarla çözerler, dolayısıyla bu iki çözüm yöntemi arasında temel farklılıklar vardır. Durum uzayındaki başlangıç noktanız, nümerik yaklaşımınızdaki iteratif bir çözüm sürecinin akışı üzerinde beklentinin üzerinde, dramatik şekilde etkili olabilir. Biz burada, bir geçiş metali olan Ruthenium içeren bir bileşik için karşılaştırmalı bir çalışma yürüttük. Söz konusu molekülü, her seferinde farklı bir başlangıç konfigürasyonu kullanarak defalarca optimize ettik. Sonrasında, farklı başlangıç noktalarının etkilerin görmek üzere, sonuçları, hesaplama zamanlarındaki değişim, varılan minimum enerji konfigürasyonlarındaki farklılık gibi değişik açılardan kıyasladık. Sonuçta başlangıç konfigürasyonunun, geçiş metali içeren bileşikler için yürütülen nümerik hesaplamalarda önemli bir parameter olduğunu ve hesaplamaların başarısını arttırmak için dikkatli seçilmesi gerektiğini ortaya koyduk.en_US
dc.identifier.citationBinbay, N. E., Binbay, V., Aydemir, M., Durap, F., Meriç,N., Kayan, C. ve diğerleri. (2019). Effect of initial configuration on DFT calculations for transition metal complexes. Avrupa Bilim ve Teknoloji Dergisi, (Özel Sayı), 256-269.en_US
dc.identifier.doi10.31590/ejosat.638072en_US
dc.identifier.endpage269en_US
dc.identifier.issn2148-2683
dc.identifier.issueÖzel Sayıen_US
dc.identifier.startpage256en_US
dc.identifier.trdizinid358397en_US
dc.identifier.urihttps://search.trdizin.gov.tr/tr/yayin/detay/358397
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11468/12190
dc.identifier.urihttps://search.trdizin.gov.tr/yayin/detay/358397
dc.indekslendigikaynakTR-Dizinen_US
dc.institutionauthorBinbay, Nil E.
dc.institutionauthorBinbay, Veysel
dc.institutionauthorAydemir, Murat
dc.institutionauthorDurap, Feyyaz
dc.institutionauthorMeriç, Nermin
dc.institutionauthorKayan, Cezmi
dc.language.isoenen_US
dc.publisherOsman SAĞDIÇen_US
dc.relation.ispartofAvrupa Bilim ve Teknoloji Dergisien_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Uluslararası Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectDFTen_US
dc.subjectRutheniumen_US
dc.subjectComputationen_US
dc.subjectRutenyumen_US
dc.subjectHesaplamaen_US
dc.titleEffect of initial configuration on DFT calculations for transition metal complexesen_US
dc.title.alternativeGeçiş metalleri için yürütülen DFT hesaplamalarına başlangıç konfigürasyonunun etkisien_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
Effect of Initial Configuration on DFT Calculations for Transition Metal Complexes.pdf
Boyut:
2.91 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Makale Dosyası
İndir
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
[ X ]
İsim:
license.txt
Boyut:
1.44 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama:
İndir

Koleksiyon

Diyarbakır Teknik Bilimler Meslek Yüksekokulu Koleksiyonu
TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu