Dargeçit ve Güçlükonak sıcak su kaynaklarından termofilik bakteri izolasyonu ve tanımlanması

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorPirinççioğlu, Hamşi
dc.date.accessioned2015-07-01T11:11:16Z
dc.date.available2015-07-01T11:11:16Z
dc.date.issued2015
dc.departmentDicle Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Anabilim Dalıen_US
dc.description.abstractMardin ili Dargeçit ve Sırnak ili Güçlükonak ilçeleri sıcak su kaynaklarından su ve çamur örnekleri alınarak bakteri izolasyonu yapıldı. Bu bakterilerin morfolojik, fizyolojik, biyokimyasal özellikleri, lipit analizi ve 16S rRNA dizi analizi yapılarak tanımlanması yapıldı. Hısta (Güçlükonak) sıcak su kaynagından izole edilen iki tane izolat GE1 ve GE2 olarak adlandırıldı. Bu izolatlar çubuk seklinde, gram-pozitif, aerobik, hareketli ve spor olusturan termofil karekterde oldukları belirlendi. GE1'in basilleri genellikle ikili halde GE2'nin ise tekli halde bulunmaktadır. Üreme sıcaklık aralıgı GE1 için 30-65 ºC (optimum 60ºC), GE2 içinde 35-65 ºC (optimum 60ºC) olarak bulundu. Optimum üreme pH'sı GE1'in 9.0, GE2'nin 9.5 olarak bulundu. GE1 ve GE2'nin büyüme grafigi çizildi ve sırası ile 15. ve 12. saatlerde en yüksek oranda üredikleri görüldü. GE1 ve GE2'nin nisasta, katalaz, üreaz, fosfataz testleri pozitif tespit edildi. zolatların %1'lik NaCI'e tolerans gösterdikleri saptandı. GE1'in karbon kaynagı olarak galaktoz, sakkaroz, maltoz ve laktozu kullandıgı; glukoz, fruktoz ve gliserolü de zayıf bir sekilde kullandıgı saptandı. GE2'nin maltozu karbon kaynagı olarak kullandıgı, glikoz ve sakkaroz da zayıf olarak kullandıgı tespit edildi. Ilısu (Dargeçit) kaplıcasından izole edilen, AH1 ve AH2 olarak adlandırılan izolatlar çubuk sekilli, gram-pozitif, spor olusturan, aerobik, hareketli termofilik özellikte bakterilerdir. Hücreleri genellikle ikili halde bulunmaktadır. AH1'in üreme sıcaklık aralıgı 30-65 ºC (optimumu 60 ºC) olarak bulundu. AH2'nin üreme sıcaklık aralıgı ise 30-65 ºC (optimum 65 ºC) olarak bulundu. AH1'in pH üreme aralıgı 5.5- 10.0 (optimum 7.5) bulundu. AH2'nin pH üreme aralıgı 6.0-11.0 (optimum 7.5) olarak bulundu. AH1 ve AH2' nin büyüme grafigi incelendiginde, çogalmanın sırasıyla 24. saat ve 15. saat oldugu saptandı. zolatların nisasta hidrolizi, katalaz, kazein, lipaz ve fosfataz testleri pozitif olarak tespit edildi. Her iki izolatın da lizozim duyarlılıgı ve sodyum azid duyarlılıgı pozitif görüldü. Ayrıca izolatların %2'lik NaCI'e toleranslı oldukları görüldü. AH1'in karbon kaynagı olarak galaktoz ve gliserolü zayıf olarak kullandıgı tespit edildi. AH2'nin ise sakkaroz, laktoz ve gliserolü zayıf bir sekilde kullandıgı tespit edildi. GE1, GE2, AH1'in lipit analizleri Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. rittmannii ve Geobacillus toebii standartları ile yapılan karsılastırmalarda izolatların fosfolipitleri, glikolipitleri ve aminolipitlerinin Geobacillus standatlarına benzerlik gösterdigi görüldü. GE1'in 16S rRNA gen dizisinin veri tabanındaki diger türlerle karsılastırılması soncunda Geobacillus cinsine ait türle yakınlık gösterdigi görüldü. Geobacillus cinsinin yeni bir türü olabilecegi düsünülmektedir. GE2'nin 16S rRNA gen dizi analizi sonuçları diger türlerle karsılastırıldıgında Geobacillus kaue'a yakınlık gösterdigi görüldü. AH1 ve AH2'nin 16S rRNA gen dizi analizi veri tabanındaki mevcut türlerle karsılastırıldıgında Anoxybacillus flavithermus'a % 99 oranında yakınlık gösterdigi bulunmustur. Anahtar Kelimeler: Bakteri tanımlanması, termofilik bakteri, 16S rRNA, Sıcak su kaynagı
dc.description.abstractIn Dargeçit, Mardin and in Güçlükonak, Sirnak districts of hot springs water and mud samples of bacteria were isolated. Morphological, physiological, biochemical characteristics, lipid analysis and identification 16S rRNA sequence analysis of these bacteria was performed and identified. Two strains isolated from hot springs of Hısta (Güçlükonak) was called GE1 and GE2. These isolates were rod shaped, gram-positive, aerobic, and sports animated character has been identified as forming thermophile. Bacillus of GE1 is usually found as bilateral. Otherwise, bacillus of GE2 is found as asingle. 30-65 ºC (optimum 60 °C) for GE1 and 35-65 ºC (optimum 60 °C) for GE2 was found as the temperature range of reproductive. Optimum growth pH for GE1 and GE2 were found 9 and 9,5. Growt graphic of GE1 and GE2 were drawn and produce the highest rate of they were seen in the fifteenth and twelfth hours, respectively. Starch, catalase, urease, phosphatase tests of GE1 and GE2 have determined positive. 1% NaCI tolerance of isolates were found to show. GE1 used galactose, sucrose, maltose and lactose as carbon source; glucose, fructose and glycerol which are used in a way that very little was stated. GE2 used maltose as the carbon source, glucose and were used as the weak. Strains isolated from hot springs of Ilısu (Dargeçit) was named AH1 and AH2. These bacteria are rod-shaped, gram-positive, spore forming, aerobic, active thermophilic properties. Cells of these bacteria are usually bilateral. 30-65 º C (optimum 60 ° C) was found as temperature range of reproductive for AH1, 30-65 (optimum 65 ° C) was found as the temperature range of reproductive for AH2. Reproductive pH range was found 5.5-10 (optimum 7.5) for AH1. reproductive pH range 6-11 (optimum 7.5) was found. Reproductive pH range was found 6-11 (optimum 7.5) for AH2. The optimum time to produce for AH1 and AH2 have been seen 24th and 15th hours, respectively. Starch hydrolysis, catalase, casein, lipase and phosphatase tests of isolates were positive. the lysozyme sensitivity and sodium azide sensitivity of both isolates have been seen positive. 2 % NaCI tolerance of isolates were found to show. AH1 as a carbon source used galactose and glycerol poorly. AH2 also used sucrose, lactose, and glycerol in a weak manner were determined. Lipid analysis of GE1, GE2, AH1, the comparison with standard isolates Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. rittmannii and Geobacillus toebii, phospholipids, glycolipids and amino lipids of isolates were similar to the standard of the Geobacillus toebii. 16S rRNA gene sequence database of GE1 by comparing with other species in the genus Geobacillus species were found to sympathize with. A new species of the genus Geobacillus is thought to be. 16S rRNA gene of GE2 compared with other types of analysis is showed Geobacillus kaue'a sympathize. 16S rRNA gene sequence analysis of AH1 and AH2 in comparison with the existing data base is similar to Anoxybacillus genus and Anoxybacillus flavithermus was 99 % affinity. Keywords: Bacterial identification, thermophilic bacteria, 16S rRNA, Hot springs
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11468/1204
dc.institutionauthorPirinççioğlu, Hamşi
dc.language.isotren_US
dc.relation.publicationcategoryTezen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/closedAccessen_US
dc.subjectBakteri tanımlanmasıen_US
dc.subjectBacterial identificationen_US
dc.subjectTermofilik bakterien_US
dc.subjectThermophilic bacteriaen_US
dc.subject16S rRNAen_US
dc.subjectSıcak su kaynağıen_US
dc.subjectHot springsen_US
dc.subjectMardinen_US
dc.subjectDargeçiten_US
dc.subjectŞırnaken_US
dc.subjectGüçlükonaken_US
dc.subjectBakterileren_US
dc.subjectBacteriumsen_US
dc.subjectBakteri izolasyonuen_US
dc.subjectBacterial isolationen_US
dc.titleDargeçit ve Güçlükonak sıcak su kaynaklarından termofilik bakteri izolasyonu ve tanımlanmasıen_US
dc.typeMaster Thesisen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
Dargeçit ve Güçlükonak sıcak su kaynaklarından termofilik bakteri izolasyonu ve tanımlanması.pdf
Boyut:
3.33 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
İndir
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
[ X ]
İsim:
license.txt
Boyut:
1.71 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama:
İndir

Koleksiyon

Fen Bilimleri Enstitüsü Tezler