Yazar "Matpan Bekler, Fatma" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 3 / 3
  • [ X ]
    Öğe
    Combined effects of some chemicals on ?-galactosidase activity using a new semiparametric errors in variables model
    (Banats Univ Agricultural Sciences & Veterinary Medicine Timisoara, 2019) Yalaz, Secil; Matpan Bekler, Fatma; Acer, Omer
    The combined effects of some chemicals on beta-galactosidase activity by Anoxybacillus sp. FMB1 were studied using semiparametric errors in variables methodology when the error has an unknown distribution. An experimental design was chosen to explain six chemicals, dithiothreitol (DTT), phenylmethylsulfonyl fluoride (PMSF), N-ethylmaleimide (NEM), iodoacetamide (lod A), beta-Mercaptoethanol (beta-Mer) and 1,10-phenanthroline (phen) and to investigate the results. This technique constrained the number of real experiments performed while considering conceivable interactions between six chemicals. The optimal combinations of chemical concentration for maximum beta-galactosidase activity was determined as 8 mM DTT, 8 mM PMSF, 8 mM NEM, 8 mM lod A, 2 mM beta-Mer and 2 mM phen. We also compared the no measurement error case and errors in variables case. The proposed estimator shown has better performances.
  • [ X ]
    Öğe
    Evaluation of antibacterial effects of some traditional plants against pathogen microorganisms
    (Banats Univ Agricultural Sciences & Veterinary Medicine Timisoara, 2020) Guven, Kemal; Matpan Bekler, Fatma; Yalaz, Secil; Gul Guven, Reyhan; Demirtas Aksu, Merve; Ipekci, Mert; Tusar, Firdevs Rozan
    Antimicrobial resistance has been an increasing problem in public health around the world. Natural plants can be utilised as an important source for antimicrobial agents to be used in place of synthetic drugs due to their costs and side effects. Thus, it is essential to find out new, effective, safer natural antimicrobial products. In the present study, in vitro antibacterial activities of different traditional plants against pathogen microorganisms were tested. The extracts of all plants were prepared in four different solvents (ethanolic, methanolic, hexane and aqueous) and then used for disc-diffusion method. Each assay was repeated in triplicate. The analysis was carried out using two-way analysis of variance (ANOVA). The highest antimicrobial activities were obtained by methanolic extracts of Sorbus domestica against E. coli, while Methanolic Extracts of Epilobium angustifolium were effective against Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae and Pseudomonas aeruginosa. In addition, Hexanic Extract of Tragacanth gum and S. domestica had high antibacterial activity against K. pneumoniae and P. aeruginosa, respectively.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Termofilik Bacillus licheniformis KG9'a ait ß-galaktosidaz geninin Escherichia Coli'ye aktarılması ve enzimin karakterizasyonu
    (2016) Matpan Bekler, Fatma; Güven, Kemal
    Bu çalışmada sıcak su kaynağından izole edilen termofilik Bacillus licheniformis KG9 suşu; ?- galaktosidazının stabil olması, enzimin bol miktarda üretilmesi ve bu bakterinin 16S rRNA dizi analizi karşılaştırıldığında tüm genomu bilinen B. licheniformis DSM 13’e %99.9 oranında benzerlik göstermesinden dolayı gen klonlaması ve saflaştırma için kullanılmıştır. B. licheniformis KG9’un kromozomal DNA’sı izole edildi. Termofilik bakterilere ait ?-galaktosidaz geni, gen kütüphanesinden tarandı. PCR’a dayalı metodla izole edilen 4 farklı putatif ?-galaktosidaz geni (?-gal I, ?-gal II, ?-gal III, ?-gal IV) çoğaltıldı. Elde edilen PCR ürünleri pUC18?lacZ vektörüne klonlanarak Escherichia coli’ye aktarıldı ve eksprese olan koloniler seçilerek dizi analizi yapıldı. Dizi analiz sonuçlarına göre; 4 farklı putatif ?-galaktosidaz geninin, gen kütüphanesinde bulunan diğer Gram pozitif Bacillus türlerinin genlerine benzerlik gösterdiği görüldü. En yakın homolojilerin: ?- gal I %42.9 Bacillus cereus’tan tanımlanan ?-gal’a; ?-gal II %68.3 Bacillus circulans’tan tanımlanan ?-gal’a; ?- gal III %68.8 Bacillus subtilis’ten tanımlanan ?-gal’a; ?-gal VI %76.7 B. subtilis’ten tanımlanan ?-gal’a yakınlık gösterdiği belirlendi. Hem B. licheniformis KG9 hem de rekombinant E. coli’den elde edilen ?-galaktosidaz, DEAE-selüloz, Sephadex G-75 ve p-aminobenzil-1-thio-?-D-galaktopiranosid (PABTG-agarose) kromatografi yöntemleriyle saflaştırıldı. Saflaştırma kat sayısı 9.4 ve verim %85 olarak belirlendi. Saflaştırılan enzimin molekül ağırlığı nondenatüre PAGE ile yaklaşık 90 kDa olarak tespit edildi. Saflaştırılan enzimin karakterizasyonu çalışmalarında; substrat özgünlüğü için yapay (ONPG) ve doğal (laktoz) substratlar kullanılarak, metaller ve EDTA’nın etkisini belirlemek için farklı konsantrasyondaki (1, 2.5, 5, 10, 25 mM) CoCl2, MgCl2, NiCl2, CaCl2, MnCl2, HgCl2, AgCl2, FeCl2 ve EDTA kullanılarak test edildi. Ca+2 (%147), Mn+2 (%106) ve Mg+2’nin (%135) aktiviteyi artırdığı; Ag+2, Fe+2 ve Hg+2’nin ise enzim aktivitesini inhibe ettiği tespit edildi. ONPG konsantrasyonuna bağlı olarak enzimin Km ve Vmax değerleri Lineweaver– Burk plot’a göre sırasıyla 2.0792 mM ve 2.037 µmol/dk olarak hesaplandı. Laktoz konsantrasyonuna bağlı olarak enzimin Km ve Vmax değerleri Lineweaver–Burk plot’a göre sırasıyla 9.068 mM ve 1.0476 µmol/dk olarak hesaplandı. Anahtar Kelimeler: ?-galaktosidaz, klonlama, termofilik, Bacillus licheniformis KG9, saflaştırma