Yazar "Bali, Bülent" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 3 / 3
  • [ X ]
    Öğe
    Aktinomisetler tarafından üretilen biyoaktif sekonder metabolitlerin; ribozomal olmayan peptid sentetaz (NRPS) ve poliketid sentaz (PKS) genlerinin kullanılmasıyla moleküler olarak taranması
    (2013) Özakın, Süleyman; Porsuk, Ilknur; Bali, Bülent; Acer, İsmail; Yılmaz, Ebru İnce
    [Abstract Not Available]
  • [ X ]
    Öğe
    A cellulase-free, thermoactive, and alkali xylanase production by terrestrial Streptomyces sp. CA24
    (2013) İnce, Ebru Yılmaz; Porsuk, Ilknur; Bali, Bülent; Özakın, Süleyman
    Microbial xylanases have attracted much attention because of their applications in industrial processes during the past few decades. Sixty-five terrestrial actinomycetes previously isolated from rhizospheric soils of endemic plants were tested for their ability in production of xylanase. The results revealed that 33 isolates could degrade xylan on both solid and liquid media. Extracellular xylanase production by these isolates was characterized during their growth in liquid medium. Streptomyces sp. CA24, one of the most active strains, was selected for optimization of xylanase production. The enzyme secretion was enhanced when the medium was supplemented with oat spelt xylan (0.5%) and yeast extract (0.5%) at pH 10.0. Optimization of the culture conditions resulted in a 5-fold enhancement in enzyme production (255 U/mL). The most important characteristic of the enzyme is its production over a broad pH range of 6.0 10.0 during all stationary phases. The cellulase-free xylanase was optimally active at 60 °C and almost 90% stable after 4 h at 50 °C. The high levels of enzyme production obtained under alkali batch cultivation conditions, coupled with no production of cellulase, suggests the use of the local terrestrial strain Streptomyces CA24 and/or its enzyme in industrial processes such as pulp and paper production.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Karasal ortamlardan izole edilen streptomyces türlerinin sekonder metabolit biyosentez genlerinin taranması
    (2015) Bali, Bülent
    Mikrobiyal sekonder bileşikler, potansiyel olarak sahip oldukları özel yapıları ve biyolojik aktiviteleri ile doğal bileşiklerin zengin kaynaklarından birini teşkil ederler. Actinomycetales takımına dahil olan Streptomyces türleri, çoğu biyolojik olarak aktif olan sekonder metabolitleri üretme yeteneğine sahip olan organizma grubudurlar. Bu sekonder metabolitlerden başlıcaları; antibakteriyel, antifungal ve antitümör ajanlardır. Yeni biyoaktif metabolitlerin keşfi için temel strateji Streptomyces gibi iyi bilinen ve yetenekli organizmalarda yeni bileşiklerin taranmasıdır. Yeni antimikrobiyal ajanların bulunması için bunların sentezinde görevli olan biyosentetik genlerin, üretici bakterilerin genomlarında taranması yaklaşımı, farklı taksonomik gruplarda ve aktinomisetlerde uygulanmıştır. Bu yaklaşım, yüksek metabolik potansiyele sahip yabanıl tip izolatların metabolik potansiyellerinin ortaya çıkarılmasında önemli bir strateji olarak görünmektedir. Ribozomal Olmayan Peptid Sentetazlar (NRPS) ve Poliketid Sentazlar (PKS), mikroorganizmalar tarafından üretilen önemli biyoaktif bileşiklerin büyük bir kısmının sentezinde gerekli biyosentetik sistemlerdir. Bu çalışmada; endemik bitki rizosferlerinden izolasyonları ve moleküler teşhisleri yapılmış 15 farklı Streptomyces izolatının, PCR ile NRPS ve PKS-I genlerinin taranması amaçlanmıştır. Yapılan PCR taraması sonucunda izolatların tümünde NRPS ve PKS-I genleri tespit edilmiştir. Streptomyces sp. BSH50 izolatına ait NRPS genlerinin adenilasyon domainleri ve Streptomyces sp. AS29 izolatına ait PKS-I genlerinin ketosentaz domainleri klonlanarak mini gen kütüphaneleri kurulmuştur. Streptomyces sp. BSH50 ve Streptomyces sp. AS29 izolatlarının mini gen kütüphanelerinden seçilen klonların DNA dizi analizi yapılmıştır. Elde edilen sekanslar NCBI (Amerikan Ulusal Biyoteknoloji Enformasyon Merkezi) web sitesindeki BLAST programı kullanılarak analiz edilmiştir. Streptomyces sp. BSH50 izolatının, NRPS genlerine ait 11 farklı A domaini içerdiği ve bu domainlerin şimdiye kadar rapor edilmiş olanlar ile % 45 - 94 oranında değişen homolojilere sahip olduğu görülmüştür. Streptomyces sp. AS29 izolatının, PKS-I mini gen kütüphanesinin analizlerine göre ise, bu izolatın PKS-I genlerine ait 3 farklı KS domainine sahip olduğu tespit edilmiştir. Bu domainlerin Genbankasında şimdiye kadar bulunan PKS-I genleri ile % 61 - 72 oranında homolojisi tespit edilmiştir. Bundan sonraki çalışmalarda; şimdiye kadar rapor edilmiş biyosentez genleri ile düşük seviyede akrabalığı olan domainler, homolog prob olarak kullanılarak yapılacak hibridizasyon deneylerinde, ilgili izolatın genomunda, domainlerin ait olduğu gen kümelerine ulaşılmaya çalışılacaktır. Anahtar kelimeler: Streptomyces, NRPS, PKS-I, Sekonder metabolitler